Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc6bQ9D289 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trappc6bQ9D289 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc6bQ9D289 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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