Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl28Q9D1B9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Mrpl28Q9D1B9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mrpl28Q9D1B9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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