Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Mrpl55Q9CZ83 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Mrpl55Q9CZ83 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Mrpl55Q9CZ83 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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