Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Utp23Q9CX11 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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