Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rprd1bQ9CSU0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rprd1bQ9CSU0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms