Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnaseh2cQ9CQ18 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnaseh2cQ9CQ18 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnaseh2cQ9CQ18 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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