Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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