Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb1Q9CPU1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb1Q9CPU1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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