Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup155Q99P88 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms