Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrrtQ99MR6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms