Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Sh3bp5lQ99LH9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Sh3bp5lQ99LH9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Sh3bp5lQ99LH9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Sh3bp5lQ99LH9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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Sh3bp5lQ99LH9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Sh3bp5lQ99LH9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Sh3bp5lQ99LH9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Sh3bp5lQ99LH9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3bp5lQ99LH9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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