Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pagr1aQ99L02 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms