Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reep3Q99KK1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reep3Q99KK1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms