Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmed9Q99KF1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed9Q99KF1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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