Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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TrabdQ99JY4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TrabdQ99JY4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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