Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pacsin3Q99JB8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pacsin3Q99JB8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pacsin3Q99JB8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pacsin3Q99JB8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pacsin3Q99JB8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pacsin3Q99JB8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacsin3Q99JB8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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