Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg5Q99J83 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms