Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms