Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ctu1Q99J10 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ctu1Q99J10 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ctu1Q99J10 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Ctu1Q99J10 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ctu1Q99J10 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ctu1Q99J10 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ctu1Q99J10 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms