Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf144aQ925F3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf144aQ925F3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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