Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrif1Q923B3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nrif1Q923B3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nrif1Q923B3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms