Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Clip1Q922J3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clip1Q922J3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms