Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb6Q922F4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb6Q922F4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms