Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atl3Q91YH5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Atl3Q91YH5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms