Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Creb3l3Q91XE9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Creb3l3Q91XE9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms