Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
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Smg8Q8VE18 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Smg8Q8VE18 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Smg8Q8VE18 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Smg8Q8VE18 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Smg8Q8VE18 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Smg8Q8VE18 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smg8Q8VE18 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms