Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8VDP2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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