Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC56

Rnf8, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf8Q8VC56 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf8Q8VC56 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf8Q8VC56 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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