Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clptm1Q8VBZ3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clptm1Q8VBZ3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.4 ms