Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slf1Q8R3P9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slf1Q8R3P9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms