Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc12Q8R344 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms