Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casc3Q8K3W3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms