Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrtm1Q8K377 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrrtm1Q8K377 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrtm1Q8K377 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrtm1Q8K377 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrtm1Q8K377 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrtm1Q8K377 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrrtm1Q8K377 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrrtm1Q8K377 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrrtm1Q8K377 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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