Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2D3

Edc3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc3Q8K2D3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edc3Q8K2D3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc3Q8K2D3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms