Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc47a1Q8K0H1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc47a1Q8K0H1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms