Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp27Q8CEG8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Usp27Q8CEG8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Usp27Q8CEG8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Usp27Q8CEG8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp27Q8CEG8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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