Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc9Q8CDN9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc9Q8CDN9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms