Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxo43Q8CDI2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxo43Q8CDI2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms