Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8CD60 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8CD60 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CD60 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CD60 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CD60 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CD60 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CD60 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CD60 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CD60 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CD60 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CD60 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CD60 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8CD60 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8CD60 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8CD60 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8CD60 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms