Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CntrobQ8CB62 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CntrobQ8CB62 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms