Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Parp9Q8CAS9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Parp9Q8CAS9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Parp9Q8CAS9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Parp9Q8CAS9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Parp9Q8CAS9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Parp9Q8CAS9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Parp9Q8CAS9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Parp9Q8CAS9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Parp9Q8CAS9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Parp9Q8CAS9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Parp9Q8CAS9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Parp9Q8CAS9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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