Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A430089I19RikQ8C9W1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms