Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sit1Q8C503 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sit1Q8C503 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms