Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgif2Q8C0Y1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms