Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctdsp2Q8BX07 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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