Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW9

Chtf18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chtf18Q8BIW9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chtf18Q8BIW9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms