Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rufy1Q8BIJ7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rufy1Q8BIJ7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms