Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Ubash3bQ8BGG7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ubash3bQ8BGG7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ubash3bQ8BGG7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms