Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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H2-M10.4Q85ZW8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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H2-M10.4Q85ZW8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M10.4Q85ZW8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M10.4Q85ZW8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M10.4Q85ZW8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M10.4Q85ZW8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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H2-M10.4Q85ZW8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M10.4Q85ZW8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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