Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cracr2bQ80ZJ8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cracr2bQ80ZJ8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms